旅行会社を通して各格安航空券と、航空会社で買うPEX航空券のそれぞれのメリットデメリットは次ようになります。格安航空券のメリットは、どの種類の航空券と比べても値段が一番安いことと、最安チケットであること。格安航空券のデメリットは、時間、キャンセル料金、マイレージなどで制限されることが多いことです。PEX航空券のメリットは、航空会社オリジナルの割引制度の為、格安航空券に比較してキャンセル料や座席確保やマイレージなどで優遇されること、PEX航空券のデメリットは、格安航空券に比べて割高であること。（しかし特割りを利用するなど、場合によっては安くなることもあります。）航空券の予約後三日以内に、必ず航空券の料金を支払わなければならないことです。

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